חשוב להבין את חשיבות שיטות בידוד האקסוזומים, אשר ממלאות תפקיד מרכזי בתקשורת בין-תאית ובמנגנוני מחלות. אקסוזומים הן שלפוחיות(וזיקולות) זעירות המופרשות על ידי תאים, המכילות ביומולקולות כגון חלבונים ורצפים גנטיים, שיכולים להשפיע על תפקוד תאים סמוכים. באמצעות הבנה של תהליכי הבידוד, ניתן לחקור את מנגנוני העברת המסרים התוך-תאית ולחשוף את תהליך התפתחותן של מחלות רבות.
מחקר האקסוזומים חשוב לא רק למדע הבסיסי, אלא גם לרפואה המתקדמת. הבנה מעמיקה של שיטות בידוד אקסוזומים תוכל לחשוף סודות ביולוגיים ולתרום לחדשנות ולקדמה בתחום הרפואי.
מה הם אקסוזומים / וזיקולות חוץ-תאיות?
מכיוון שמקורן הביולוגי של וזיקולות שונות קשה לזיהוי מדויק, האגודה הבינלאומית לווזיקולות חוץ-תאיות (ISEV) המליצה במסמך ההנחיות שלה MISEV2018 לקרוא להן לפי מאפיינים ברורים:
אופן מתן שמות לווזיקולות חוץ-תאיות
| בסיס המיון | דוגמה |
| מאפיינים פיזיים | וזיקולות קטנות / בינוניות / גדולות (sEVs / mEVs / lEVs) |
| צפיפות | EVs בצפיפות נמוכה / בינונית / גבוהה |
| סמני שטח ביוכימיים | EVs מסוג CD63+ / CD81+ |
| תנאי בידוד או תא מקור | EVs מתאים פודוציטים / EVs מהיפוקסיה |
| סוגי וזיקולות נוספים | גופיפי אונקוזומים / גופיפי אפופטוזיס |
ההבדל בין ליפוזומים לאקסוזומים
לעומת נשאים סינתטיים כגון ליפוזומים וננו-חלקיקים, לאקסוזומים יש יתרונות כמו מקור פנימי (אנדוגני) והטרוגניות ביולוגית. בזכות זאת, הם נשאים מצוינים שיכולים לשאת חומרים ביולוגיים פעילים ולכוון אותם לתאים ספציפיים – לתיקון רקמות, ויסות חיסוני, יצירת כלי דם, התמיינות תאית, התפתחות גידולים ועוד.
יתרונות וחסרונות של אקסוזומים
יתרונות:
- פוטנציאל למחקר ביולוגי
- סמן ביולוגי לאבחון מחלות
- נשא לתרופות (למשל לסרטן)
חסרונות:
- יציבות נמוכה
- תפוקה נמוכה
- טוהר נמוך
- מיקוד ביולוגי חלש
טבלה השוואתית בין סוגי וזיקולות
| סוג הווזיקולה | גודל | מוצא ביולוגי |
| אקסוזומים | 40–120 ננומטר | גופיפים רב-שלפוחתיים (MVB) |
| מיקרו-וזיקולות | 100–1000 ננומטר | קרום פלזמה (ניצול כלפי חוץ) |
| גופיפי אפופטוזיס | 1000–5000 ננומטר | תהליך אפופטוזיס תאי |
שיטות לבידוד אקסוזומים
הבידוד, הטיהור והריכוז של אקסוזומים קריטיים להערכת תפקודם ולשימושים עתידיים. הבידוד מאתגר בשל ההרכב המורכב של דגימות ביולוגיות וההטרוגניות של האקסוזומים עצמם.
השוואה בין שיטות בידוד אקסוזומים
| שיטה | עקרון | תפוקה | טוהר | תפקודיות | זמן | נפח דגימה | פגיעה באקסוזומים | מורכבות | היתכנות להרחבה | הערות |
| אולטרה-צנטריפוגה | גודל, צפיפות | נמוכה | בינונית | בינונית | > 4 ש' | גבוהה | כן (מהירות גבוהה) | בינונית | בינונית | תהליך מורכב וזמן רב |
| סינון כרומטוגרפי לפי גודל | רדיוס הידרודינמי | בינונית | בינונית-גבוהה | גבוהה | 0.3 ש' | בינונית | לא | פשוט | גבוהה | שימוש גמיש |
| אולטרה-פילטרציה | גודל, משקל מולקולרי | גבוהה | בינונית | בינונית | < 4 ש' | גבוהה *(TFF) | כן (כוחות גזירה) | פשוט | בינונית-גבוהה | סתימת ממברנות |
| שקיעה | מסיסות, מטען שטח | גבוהה | נמוכה | נמוכה | 0.3~12 ש' | גבוהה | כן | פשוט | גבוהה | קיטים יקרים |
| אימונואפיניות | קישור סלקטיבי | נמוכה | גבוהה | נמוכה | 4–20 ש' | קטנה | כן (שלבי זיקוק) | בינונית | נמוכה | טיהור סלקטיבי יקר |
בידול בין אולטרה-פילטרציה רגילה לסינון זרימה טנגנציאלית (TFF)
האולטרה-פילטרציה יכולה להתבצע בכמה דרכים:
- צנטריפוגה עם צינורות פילטר
- פילטרים מופעלים בלחץ
- TFF (סינון זרימה טנגנציאלית)
TFF מתגבר על בעיית סתימת הממברנה ומאפשר:
- תפוקה גבוהה יותר
- טוהר משופר
- חיסכון של עד 40% בזמן בהשוואה לאולטרה-צנטריפוגה
Tanfil 100 – מערכת סינון TFF בקנה מידה מעבדתי
- מערכת "חבר והפעל" כוללת הכול
- ריכוז וסינון בו זמנית
- מתאימה גם ל-DNA ו-RNA
- קלה להרחבה לתעשייה
- אין סתימות ממברנה, חיי שירות ארוכים
- אישורי CE, RoHS, UKCA
שיפור יעילות הבידוד
כיום נהוג לשלב מספר שיטות בידוד – שילוב זה מביא ל:
- תפוקה גבוהה יותר
- טוהר משופר
- איזון בין יתרונות וחסרונות של כל שיטה
דוגמאות לשילובים בבידוד אקסוזומים עם TFF
| מטרה | גישה | טיהור | ריכוז | גודל פילטר | שם מסחרי | מקור הדגימה |
| אקסוזומים | TFF → SEC | כן | כן | 5 ננומטר | TFF-Easy | מדיה של תאי גזע |
| EVs | TFF → SEC | כן | כן | 50 ± 10 נ"מ | TFF-EVs | סרום עשיר בטסיות |
| אקסוזומים | UC → TFF | | כן | 5 ננומטר | TFF-Easy | מדיה של תאי NK-92 |
| צמחיים | dUC → TFF | | כן | 5 ננומטר | TFF-Easy | טבק |
| אקסוזומים | TFF → קיט Qiagen | | כן (10–20X) | 5 ננומטר | TFF-Easy | מדיה מתאי סרטן |
| אקסוזומים | LSC* → TFF | כן | כן | 100 קילודלטון | Minimate | מדיה מתאי EF-MSCs |
| EVs | LSC* → TFF | כן | כן (50X) | 300 קילודלטון | Minimate | תאי שומן |
| EVs | TFF | כן | כן (4–20X) | 0.65 μm, 500 kDa | Spectrum Labs | מדיה וליפואספירציה |
*LSC: צנטריפוגה במהירות נמוכה
שימושים של אקסוזומים
- אבחון/פרוגנוזה של מחלות – סמן ביולוגי מדויק לאלצהיימר, פרקינסון, סרטן, מחלות אוטואימוניות ונוירולוגיות.
- טיפול במחלות – כנשא תרופתי, רפואה משקמת, טיפול ממוקד.
- מחקר ביולוגי – לחקר מנגנונים פיזיולוגיים ופתולוגיים בעזרת DNA, miRNA ועוד.